Генеральная прокуратура внесла иск о возвращении имущества СПбГУП государству. По мнению надзора, Федерация независимых профсоюзов России незаконно оформила его на свою собственность, а руководитель вуза, Александр Запесоцкий, в течение многих лет использовал университет для личного обогащения.

Иск был подан генпрокурором Игорем Красновым лично, и 22 сентября он был направлен в Арбитражный суд Санкт-Петербурга и Ленинградской области. Согласно данным органов надзора, годовой оборот учебного заведения составляет от 0,5 млрд до 1 млрд рублей, при этом Запесоцкий каждый год заявляет о убытках перед государством для получения субсидий.

Кроме того, глава университета, злоупотребляя своим положением, за период с 2022 по 2025 год незаконно распорядился денежными средствами учебного заведения и выдал займы своему сыну на сумму 48 млн руб. СПбГУП регулярно становится объектом скандалов, а сам Запесоцкий известен своим «экстравагантным» поведением.

В разное время в университете проводились проверки внешности студентов, а в 2014 году СПбГУП объявил об отчислении 150 студентов за их активность в социальных сетях. С начала вооруженных действий на Украине студенты университета рассказывали журналистам о наказаниях за антивоенную позицию.

Согласно сайту университета, с 2012 года Запесоцкий является доверенным лицом Владимира Путина. В апреле 2024 года президент РФ наградил его орденом Александра Невского за заслуги в научно-педагогической деятельности, подготовке высококвалифицированных специалистов и многолетнюю добросовестную работу.